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9月18日自然杂志精选

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来源: 作者: 2019-05-17 00:56:54

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丽鱼科鱼基因组适应性辐射的标志

在非洲大裂谷的湖泊和河流中发现的2000种左右的丽鱼科鱼,是适应性辐射的经典例子。这1大规模国际合作项目,对5个截然不同世系的非洲丽鱼科鱼的基因组和转录组进行了测序和分析。所获数据显示,与其他鱼种相比,它们的基因复制过多。存在大量非编码要素分化、加速的编码序列演变、直系同源基因对中与可转座要素插入相干的表达分化和由新颖miRNA进行的调控。对来自6个密切相干的维多利亚湖鱼种的60个个体所做的测序数据,指向丽鱼科鱼与对编码变体和调控变体的全基因组分化选择相关的迅速物种构成,同时也说明古代纯化选择放松的时期使得既有变异能够累积,后者在增进分化中可能起重要作用。

结肠直肠肿瘤的蛋白质组 这些年,我们“刷”过的热词
/ 基因组研究

来自“临床蛋白质组学肿瘤分析联合体”的一个研究小组,现在对之前被“癌症基因图谱”项目表征的95个结肠和直肠肿瘤的蛋白质组进行了分析。蛋白质组数据与原始基因组数据的整合显示,蛋白丰度无法从DNA或RNA水平的测定结果得到可靠预测,mRNA水平和蛋白水平的关联程度也不大。蛋白质组研究识别出5个结肠直肠癌亚型,它们反映了已知的生物学特点,但也捕捉到了在转录组层面上其实不明显的差别。这种类型的整合“蛋白基因组分析”,在癌症生物学中可以为解释基因组异常提供功能背景。

人类“后期增进复合物”的结构

“后期促进复合物/细胞周期体”(APC/C)是一种大型E3连接酶,介导细胞周期调控蛋白的依赖于泛素的蛋白水解,以在复制和细胞分裂进程中控制各种事件。在这项研究中,David Barford及同事利用低温电子显微镜方法,以7.4的分辨率确定了人类APC/C在与其辅活化因子CDH1和基质HSL1所形成的复合物中的二次结构架构。该结构信息使研究人员能够对APC/C全部20个亚单元的位置和架构予以确定,同时也可帮助认识CDH1是怎样刺激APC/C的泛素化活性的。

超小星系拥有超大质量黑洞

天体M60-UCD1 是目前已知最亮的“超小型矮星系”(UCD),也是质量最大的UCD之一(大约为2亿个太阳质量)。Anil Seth等人利用自适应光学光谱对M60-UCD1的动力学问题进行了研究。他们在其中心探测到一个超大质量黑洞,大小为2100万个太阳质量。M60-UCD1因而是具有一个超大质量黑洞的已知质量最低的系统。作者提出,它可能曾处在另一个更大星系的中心,后者之后被一个质量巨大的相邻星系通过潮汐作用分裂了。他们的分析还表明,M60-UCD1的恒星质量与其亮度一致。

撒哈拉沙漠比人们所想老得多

大多数证据证明,现代撒哈拉沙漠最初是在距今300万到200万年前构成的,这个时间与北半球大规模冰川化的开始时间相一致。这项研究表明,撒哈拉沙漠的形成时间要早很多。Zhongshi Zhang等人发现,特提斯海(现代地中海、黑海和里海的前身)的萎缩减弱了非洲季风的向北延伸,导致撒哈拉沙漠在距今大约700万年前构成。对之前判断如此巨大的修正,可能会导致地质学、演化生物学和气候学等不同领域对撒哈拉进行新的研究。

黑猩猩天生有攻击性

对我们现存亲缘关系最近的动物黑猩猩和倭黑猩猩所作的研究,在试图了解人类本身攻击行为之演化的工作中一直很有影响。然而近年来,这些研究的可靠性受到“人类影响假说”支持者的质疑,后者认为,黑猩猩暴力的出现主要是人类活动的结果。现在,对有关非洲各地的黑猩猩和倭黑猩猩的研究工作所作的一项元分析显示,黑猩猩之间的攻击,是为取得资源或交配对象而采取的适应性策略的正常的和预期的产物,与人类的存在或不存在没有关系。

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